El departament de Transports té al seu càrrec l'exercici de les competències en matèria de transports terrestres en l'àmbit territorial de l'illa d'Eivissa. Aquestes competències incloeixen la gestió administrativa de totes els títols habilitants, autoritzacions,  per a l'exercici de l'activitat de transport públic i privat de transport de mercaderies i de viatgers.

Així aquest departament realitza tota la tramitació necessària per a l'obtenció de noves autoritzacions, renovació, substitució de vehicles, etc relacionades amb tot el catàleg d'autoritzacions administratives d'àmbit nacional i que s'incorporen al Registre Nacional de Transportistes.

Pel que fa a l'obtenció de qualificacions personals, també resulta competent per a l'examinació de les persones que hagi d'obtenir el CAP (certificat d'aptitud dels conductors professionals, modalitat de viatgers i mercaderies) així com per a l'obtenció de la titulació de competència professional per a l'exercici de lla professió de transportista (de mercaderies i de viatgers).

La gestió administrativa comporta igualment el control de la seva possessió i l'acompliment de les condicions d'ús que recull la normativa, i a l'efecte s'exerceix la potestat inspectora i sancionadora en el cas de detectar  infraccions contra la normativa de transport terrestre en l'àmbit de l'illa d'Eivissa.

Finalment, i molt important, el Consell Insular d'Eivissa és el titular de les línies de transport regular de viatgers per carretera de l'illa, el servei de transport regular en autobús. aquest servei es presta a través d'empreses contractistes del servei (concessionària) i resulta competència del Consell Insular d'Eivissa la seva definició, determinació del servei, règim tarifari, etc. En aquest moment s'està en ple procés de pròxima substitució del sistema vigent durant les darreres dècades a un nou contracte de prestació dels serveis de transport regular que hauran de millorar sensiblement les condicions de la seva prestació a nivell insular.